增值税固然有税不重征等优点，但是由于采取凭票扣税的方式，虚开与接收虚开发票一直是增值税制度的恶疾，增值税扩围改革后要大力加强征管，以减少虚开增值税专用发票违法行为的发生。
　　(一)目前在虚开发票案件检查中，税务机关基本上是按照“票、货、款、运输“四流来进行检查，而劳务具有来无踪去无影，看不见实物，且价值难以准确计量的特点，因此将使得虚开案件更加难以检查。
　　(二)目前交通运输业由于“低征高抵”的特点，一直是虚开发票的高危领域，上海增值税扩围后，“低征高抵”的漏洞得到遏制，但预计随之而来的是虚开发票问题的前移。例如，上海扩围之前，为了少缴税款，采取运输企业多开发票，征收3%的营业税，而生产企业多抵扣的虚开行为，交通运输业改征增值税后，犯罪手法会改为运输企业去多取得柴油发票作为进项税额，从而对生产企业二次虚开的方法。
　　(三)面对上海扩围后可能的虚开案件抬头现象，稽查部门要研究检查方式，将过去检查虚开案件重视“物流”的检查方法，由于交通运输业和部分现代服务业，没有“物流”存在，因此检查方法要转变为特别重视“资金流”检查方式。