答：根据《国家税务总局关于印发<企业所得税汇算清缴管理办法>的通知》(国税发〔2009〕79号)规定，预缴税款超过应纳税款的，主管税务机关应及时按有关规定办理退税，或者经纳税人同意后抵缴其下一年度应缴企业所得税税款。因此，您公司季度有预缴所得税，年度汇算清缴亏损，对已经预缴的所得税款，可办理退税或经您公司同意抵缴下一年度应缴企业所得税税款。